细胞的物理环境影响深远。位于马萨诸塞州波士顿的Wyss研究所的研究人员发现，单独的机械蠕动变形和流体流动变化可以在不对生长培养基进行任何改变的情况下诱导来自细胞的功能性绒毛，否则细胞会变平6。

       不同品牌的实验室培养皿将不同的化学物质浸入细胞培养基中，并且可能混淆细胞代谢物的研究。故意添加剂可以以不受重视的方式改变细胞代谢：特别是抗生素经常损害线粒体活性。即使实验室冰箱上的玻璃门也会破坏实验，因为生长介质中的某些化学物质对光敏感。只需改变实验室平板，从而改变细胞所处的介质高度，就可以改变细胞的行为方式。更重要的是，在特定培养物中生长的细胞并不完全相同，并且最能繁殖的细胞亚群可以迅速占据群体的主导地位。这意味着如果研究人员决定恢复以前的实验条件，细胞可能不会恢复到以前的行为。

       在所有这些实验中，细胞本身是最重要的变量。伦敦大学学院的癌症研究员，细胞培养参考书的作者约翰马斯特斯说，没有快速，简单的方法可以知道细胞是否适合用途。“了解你的细胞，”他敦促道。“你知道细胞是多么幸福的******方法就是看它们。”

     当细胞快速生长或持续存在于静止期时，细胞的反应不同。如果它们“过度通过”（即，在培养中保存太长时间），则可能发生其他变化并影响再现性。即使细胞系的遗传特性已被认证 - 如现在广泛推荐的那样 - 其他关键属性，例如生长状态，倍增次数和污染检查，往往仍然没有记录。“身份验证不仅仅意味着身份，”里德说。希望重现实验的研究人员不应该“像侦探那样行事”，以便根据报告的研究来确定细胞所处的状态。

     具有良好显微镜图像或表达数据的具体数据可以帮助研究人员识别他们实验中使用的细胞何时发生变化，美国马里兰州盖瑟斯堡国家标准与技术研究所的分部负责人Anne Plant表示，他希望找到这些数据。使细胞培养实验的定量方法在实验室中具有可比性。“评估最困难的事情之一是什么构成一个健康的细胞，”她说。

对于那些忽视将细胞视为“需要照顾和照顾的生物”的研究人员来说，更难的是后果，“马斯特斯说。“某人的博士学位下降，或者补助金丢失，或多年的工作被浪费，因为他们没有做相当简单的质量控制。”